Ako vypočítať katalytickej účinnosti

Enzýmy sú základné molekuly - katalyzujú reakcie , ktoré robia život stane . Prírodné ponúka pozoruhodnú rad enzýmov , ktoré katalyzujú širokú škálu reakcií . Pri porovnávaní týchto enzýmov , môže byť niekedy užitočné , aby ich zvážiť, pokiaľ ide o ich katalytickej účinnosti, tiež nazývaný špecifickosť konštanta , ktorá meria , ako efektívne prevádza enzým substrát ( na molekulu pôsobia na ) do výrobku . Pre enzýmy, ktoré nasledujú , čo biochemici volanie Michaelis - Mentenové kinetiku , táto konštanta môže byť ľahko vypočítať z experimentálnych dát . Návod
Stránka 1

Zapíšte km a kcat . Tieto konštanty sú určené experimentálne , takže by ste mali už skôr , ako začnete sa snaží vypočítať špecifickosť konštantné .
2

Pripomeňme , že Km predstavuje ( k - 1 + k2 ) /K1 , kde k1 je rýchlostná konštanta pre tvorbu komplexu enzým - substrát komplexu , k - 1 , je rýchlostná konštanta pre rozpadu tohto komplexu , a k2 je rýchlostná konštanta pre tvorbu produktu z komplexu enzým - substrát . Ďalší ( a možno viac osvetlenia ) spôsob , ako definovať Km je koncentrácia substrátu , keď je reakcia beží na polovicu maximálnej rýchlosti . Ak je enzým má veľkú Km , to trvá veľa substrátu na dosiahnutie maximálnej rýchlosti enzýmu , zatiaľ čo malý Km znamená , že sú potrebné iba trochu substrátu k nasýteniu dispozícii enzým .
3

Pripomeňme , že kcat je rýchlostná konštanta pre krok limitujúci rýchlosť reakcie katalyzovanej enzýmom . Krok obmedzujúce rýchlosť je najpomalší krok alebo prekážkou, ktorá určuje, ako rýchlo sa celková reakcia môže bežať .
4

Rozdeliť kcat KM dostať špecifickosť konštantný . Napríklad , ak kcat je 600 sekúnd ^ -1 a Km je 10 umol , potom katalytické účinnosti je 60 mikroM ^ -1 s ^ -1 .
5

Všimnite si , že rýchlosť difúzie sady horná hranica na maximálnu katalytickej účinnosti, obvykle rádovo 10 ^ 8-10 ^ 9 m ^ -1 s ^ -1 . Biochemici sa niekedy hovorí, že enzým , ktorého katalytická účinnosť k tejto hranici blíži dosiahla " katalyzátor dokonalosti " .