Keď kyslý dážď padá do jazera alebo potoka , znižuje pH rovnováhu vodného telesa. Podľa US Environmental Protection Agency , väčšina potokov a jazier majú prirodzenú hladinu pH medzi 6,0 a 8,0 . Vodné plochy s hodnotou pH 5,0 alebo nižšie , sú považované za veľmi kyslé . Topenie snehu a silný dážď s chemickým zložením môže spôsobiť krátke kyslé odtok v niektorých oblastiach . Mnoho jazier a potokov v USA sú citlivé na tejto epizodické acidifikácie , ktoré môžu spôsobiť " úhynu rýb . "
Vodných živočíchov
Keď kyslý dážď vstúpi do vody , hliník hladiny sa zvyšujú v jazere alebo rybníku a znižuje hladinu pH . Tieto faktory môžu spôsobiť chronický stres pre ryby , čo má za následok nižšiu telesnej hmotnosti; to môže urobiť je menej schopný pri súťažení na jedlo . Mladší vodné živočíchy majú ťažšie vyrovnať sa s týmito podmienkami ako u dospelých . Väčšina rýb vajcia sú schopní vymyslieť s hodnotou pH 5,0 alebo nižšia . Podľa EPA , môže žaby odolať hodnotu pH 4,0 alebo vyšší , zatiaľ čo lastúrniky a ulitníky vydrží len hodnotu pH 6,0 a viac . Vzhľadom k tomu , ekosystém je na sebe vzájomne závislé , aj keď zviera vyššia o potravinovom reťazci znesie nižšej úrovne pH , nemusí jeho jedlo . Zníženie dodávky potravín znižuje rozmanitosť v rámci kyslé ekosystému .
Pôda a lesy
Kyslý dážď môže spôsobiť rastliny a stromy v lese rastú pomalšie alebo dokonca zomrieť . Stromy sú oslabené , ak chemikálie vstrebáva cez listy a korene , škody , zranenia alebo smrť . Keď kyslý dážď alebo sneh , to presakuje do pôdy , ale môže byť neutralizovaný. Podľa EPA , to sa nazýva " vyrovnávacej pamäti zóna " a neutralizácia kyseliny závisí od obsahu v pôde . Prostredie, ako je Catskill horách majú nízke pufrovacej pôdy , čo má za následok viac stromov zasiahnutých kyslými dažďami . Štáty ako Nebraska a Indiana mať silnejšie vyrovnávacej pamäti pôdy , čo má za následok menej kyslých dažďov poškodenie týchto lesov .